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Rede Genômica Fiocruz

A Rede Genômica Fiocruz reúne especialistas de todas as unidades da Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz) no Brasil e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-CoV-2 por meio da decodificação do genoma viral. Assim, é possível acompanhar as linhagens e mutações genéticas do novo coronavírus e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes.

Desde março de 2020 o grupo, que inclui o Laboratório de Referência Nacional em vírus respiratórios junto ao Ministério da Saúde e de referência para a Organização Mundial da Saúde em Covid-19 nas Américas, está atuando ativamente na vigilância genômica do SARS-CoV-2. A Rede participa da iniciativa internacional de acesso aberto a informações sobre genomas de vírus influenza e coronavírus, o GISAID, sendo um dos grupos curadores da iniciativa na América do Sul.

A Rede fornece capacitação e suporte técnico em sequenciamento e geração de dados para técnicos e especialistas de instituições de todo o país e da América do Sul a partir de cooperação com a Organização Pan-Americana da Saúde (OPAS).

A Rede Genômica está aberta para formalização de novos parceiros. Caso tenham interesse, por favor entrar em contato com genomahcov@fiocruz.br.

Fotografia ilustrando pesquisadora em processo de análise de dados utilizando computadores. À esquerda da imagem, temos uma mulher de pele bege clara, utilizando máscara facial do tipo PFF2, com roupas comuns — ou seja, sem equipamentos de proteção, uma vez que não está lidando diretamente com a bancada. Ela está vestida com uma camisa azul, e uma blusa preta por cima, com as mangas puxadas até a altura da base do antebraço. A mulher possui ainda cabelos castanho escuros com as pontas descoloridas, usa um esmalte em cor cinza-amarronzada e, no braço esquerdo, um relógio de pulso com pulseira em cor prata. A pesquisadora está sentada a uma mesa, e apenas seu busto está enquadrado na imagem. Sobre a mesa, temos um computador do tipo notebook e um monitor de computador grande, no qual são exibidos dois gráficos, um de barras e outro de área. No notebook está disposta a página do GISAID, o banco de dados internacional cooperativo para depósito e análise de sequências de genoma de Influenza e do SARS-CoV-2.
Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de pesquisa que faz análises com material biológico. Sobre uma bancada de dor branca, temos um aparelho denominado fluorômetro, que mede a fluorescência emitida em uma amostra depositada dentro de um tubo específico. O fluorômetro em questão consiste em um aparelho retangular com as bordas arredondadas, em cor branca e com uma tarja azul escura. Emoldurada por um retângulo preto, temos uma tela que exibe um menu em cor azul com algumas opções que não estão legíveis na foto. Ao lado direito da bancada, temos a porção do ventre de uma pessoa com avental descartável na cor azul, luvas descartáveis na mesma cor, da qual estão também na fotografia duas mãos. Na mão direita da pessoa, temos um tubo, que está sendo depositado no fluorômetro, em um poço designado para esta função. Próxima a este poço, temos uma tampa com dobradiça, que é parte do aparelho. Ao lado do fluorômetro, temos uma folha de papel e uma caneta, com uma ponta plástica vermelha em uma das extremidades, e a ponta esferográfica prateada na outra extremidade. Sobre a bancada, mais ao fundo, também estão alguns cabos de energia, uma microcentrífuga, algumas micropipetas e outros utensílios de laboratório.
Fotografia de um equipamento para distribuição automatizada de suspensões líquidas para as mais diversas finalidades em um laboratório de análises. Este equipamento é também conhecido como "robô pipetador", por realizar o processo de distribuição de líquidos em placas, e ainda dispõe de periféricos para incubação, etapas de lavagem utilizando beads magnéticas e também PCR. Em primeiro plano, uma tela de computador exibe o menu de um software para controle dos parâmetros de funcionamento do equipamento. A tela do computador exibe uma área retangular laranja, onde encontram-se vários botões e campos para preenchimento, cujos detalhes estão desfocados na imagem. Na porção inferior da tela, encontra-se uma porção em fundo branco com uma tabela, também ilegível. Ao fundo desta tela, temos uma série de equipamentos em metal e plástico, por trás de uma tela de acrílico com molduras metálicas. Mais ao fundo, temos um adesivo amarelo com o símbolo de risco biológico.
Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de pesquisa. Nesta, sobre uma bancada de cor branca na parte de baixo, encontram-se dois suportes para tubos pequenos de microcentrífuga. Estes suportes são em cor azul clara e possuem quatro fileiras de dez poços cada, em alguns dos quais estão depositados tubos de dois tipos: um deles com tampa transparente e o outro com tampa laranja. Atrás da mesa, temos duas pessoas, com a imagem capturando apenas a porção de seus ventres, com parte dos braços e mãos visíveis. Ambas as pessoas vestem aventais de laboratório na mesma cor azul dos suportes de tubos, e luvas descartáveis no mesmo tom de azul. Para evitar a exposição de pele, as luvas estão presas ao avental com o uso de fitas adesivas. A pessoa da esquerda segura uma caixa de papelão quase cheia com tubos de tampa laranja não-utilizados, e segura um destes tubos na mão, provavelmente para colocar no suporte ao lado dos outros. A pessoa da direita segura o suporte que encontra-se mais à frente, próximo à câmera.
Fotografia de um equipamento de PCR, com ênfase na tela do mesmo, onde estão dispostas diversas informações importantes para o controle do processo da reação, como a temperatura atual, temperatura da tampa, o tempo restante de reação, e um gráfico representando as temperaturas e tempos de cada etapa do processo. Uma linha horizontal representa a temperatura ao longo do tempo, subindo e descendo para representar as mudanças de temperatura características de reações de amplificação de material genético. Acompanhando a linha, estão os parâmetros de cada etapa: a temperatura da reação e o tempo no qual o aparelho deve manter esta temperatura. Uma barra amarela vertical destaca a etapa presente do processo. No caso desta foto, esta barra indica que o aparelho está no processo de elevar a temperatura de 55 graus Celsius para 72 graus Celsius, na transição da penúltima para a última etapa de cada ciclo do Estágio 3 programado no aparelho. Abaixo do gráfico, temos uma série de botões digitais, na mesma tela, retangulares, na cor laranja, com as funções de Pausar, Exibir Informações do Método; Mostrar os tempos do Método; Pular Etapa e Interromper a Reação. Mais abaixo na tela, uma tarja indica quando foi iniciado o processo, indicando Duas e Cinco da manhã do dia dezessete de fevereiro de 2022. À direita desta tarja, temos um último botão, este circular, na cor verde e com um ponto de interrogação, para maiores informações e tirada de dúvidas sobre a operação do aparelho.
Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de pesquisa. No foco principal da fotografia, temos duas pesquisadoras vestindo jalecos de laboratório em cor azul clara, toucas descartáveis para proteção capilar, máscaras do tipo PFF2, luvas descartáveis em cor azul fixadas à altura do punho com fita adesiva. A mulher da esquerda é mais alta, tem a pele na cor bege-amarronzada e sobrancelhas e cabelos pretos, enquanto a mulher à direita tem a pele bege clara e cabelos loiros, e usa óculos. A mulher à esquerda tem nas mãos uma caixa de papelão com tubos de tampa laranja não-utilizados, e retira da caixa um destes tubos. A mulher à direita dá suporte com as mãos a um suporte para tubos de tamanho pequeno (como tubos de microcentrífuga). Mais próximo à câmera, um pouco à frente das mãos da mulher à direita, temos outro destes suportes. Em primeiro plano, sobre a bancada e próximo à câmera, temos diversos suportes para tubos, preparados com duas fileiras de tubos cada, sendo uma delas composta por tubos de tampa transparente e a outra por tubos de tampa laranja. Ao fundo da fotografia, temos uma janela com vidros azulados, e uma diversidade de equipamentos e utensílios de laboratório.
Fotografia ilustrando pesquisadora em processo de análise de dados utilizando computadores. À esquerda da imagem, temos uma mulher de pele bege clara, utilizando máscara facial do tipo PFF2, com roupas comuns — ou seja, sem equipamentos de proteção, uma vez que não está lidando diretamente com a bancada. Ela está vestida com uma camisa azul, e uma blusa preta por cima, com as mangas puxadas até a altura da base do antebraço. A mulher possui ainda cabelos castanho escuros com as pontas descoloridas, usa um esmalte em cor cinza-amarronzada e, no braço esquerdo, um relógio de pulso com pulseira em cor prata. A pesquisadora está sentada a uma mesa, e apenas seu busto está enquadrado na imagem. Sobre a mesa, temos um computador do tipo notebook e um monitor de computador grande, no qual são exibidos dois gráficos, um de barras e outro de área. No notebook está disposta a página do GISAID, o banco de dados internacional cooperativo para depósito e análise de sequências de genoma de Influenza e do SARS-CoV-2.
Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de microbiologia. Na fotografia, em frente a uma parede branca, temos a visão lateral e traseira de um rosto coberto por máscara do tipo PFF2, com uma touca para proteção capilar disposta sobre cabelos pretos. Não é possível identificar nenhuma característica da fisionomia da pessoa, uma vez que muito pouco de seu rosto está visível. Mais à direita, temos, erguidas, as duas mãos desta pessoa pesquisadora, figurando na imagem a porção final dos antebraços, cobertos pelas mangas azuis de um avental descartável de laboratório, sobre as quais estão colocadas luvas azuis descartáveis. A pessoa segura nas mãos um pequeno suporte transparente, no qual estão depositados alguns tubos de amostras. A imagem sugere que esta pessoa observa algo nos tubos.
Fotografia ilustrando pesquisadora em processo de análise de dados utilizando computadores. À esquerda da imagem, temos uma mulher de pele bege clara, utilizando máscara facial do tipo PFF2, com roupas comuns — ou seja, sem equipamentos de proteção, uma vez que não está lidando diretamente com a bancada. Ela está vestida com uma camisa azul, e uma blusa preta por cima, com as mangas puxadas até a altura da base do antebraço. A mulher possui ainda cabelos castanho escuros com as pontas descoloridas, usa um esmalte em cor cinza-amarronzada e, no braço esquerdo, um relógio de pulso com pulseira em cor prata. A pesquisadora está sentada a uma mesa, e apenas seu busto está enquadrado na imagem. Sobre a mesa, temos um computador do tipo notebook e um monitor de computador grande, no qual são exibidos dois gráficos, um de barras e outro de área. No notebook está disposta a página do GISAID, o banco de dados internacional cooperativo para depósito e análise de sequências de genoma de Influenza e do SARS-CoV-2. Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de pesquisa que faz análises com material biológico. Sobre uma bancada de dor branca, temos um aparelho denominado fluorômetro, que mede a fluorescência emitida em uma amostra depositada dentro de um tubo específico. O fluorômetro em questão consiste em um aparelho retangular com as bordas arredondadas, em cor branca e com uma tarja azul escura. Emoldurada por um retângulo preto, temos uma tela que exibe um menu em cor azul com algumas opções que não estão legíveis na foto. Ao lado direito da bancada, temos a porção do ventre de uma pessoa com avental descartável na cor azul, luvas descartáveis na mesma cor, da qual estão também na fotografia duas mãos. Na mão direita da pessoa, temos um tubo, que está sendo depositado no fluorômetro, em um poço designado para esta função. Próxima a este poço, temos uma tampa com dobradiça, que é parte do aparelho. Ao lado do fluorômetro, temos uma folha de papel e uma caneta, com uma ponta plástica vermelha em uma das extremidades, e a ponta esferográfica prateada na outra extremidade. Sobre a bancada, mais ao fundo, também estão alguns cabos de energia, uma microcentrífuga, algumas micropipetas e outros utensílios de laboratório. Fotografia de um equipamento para distribuição automatizada de suspensões líquidas para as mais diversas finalidades em um laboratório de análises. Este equipamento é também conhecido como Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de pesquisa. Nesta, sobre uma bancada de cor branca na parte de baixo, encontram-se dois suportes para tubos pequenos de microcentrífuga. Estes suportes são em cor azul clara e possuem quatro fileiras de dez poços cada, em alguns dos quais estão depositados tubos de dois tipos: um deles com tampa transparente e o outro com tampa laranja. Atrás da mesa, temos duas pessoas, com a imagem capturando apenas a porção de seus ventres, com parte dos braços e mãos visíveis. Ambas as pessoas vestem aventais de laboratório na mesma cor azul dos suportes de tubos, e luvas descartáveis no mesmo tom de azul. Para evitar a exposição de pele, as luvas estão presas ao avental com o uso de fitas adesivas. A pessoa da esquerda segura uma caixa de papelão quase cheia com tubos de tampa laranja não-utilizados, e segura um destes tubos na mão, provavelmente para colocar no suporte ao lado dos outros. A pessoa da direita segura o suporte que encontra-se mais à frente, próximo à câmera. Fotografia de um equipamento de PCR, com ênfase na tela do mesmo, onde estão dispostas diversas informações importantes para o controle do processo da reação, como a temperatura atual, temperatura da tampa, o tempo restante de reação, e um gráfico representando as temperaturas e tempos de cada etapa do processo. Uma linha horizontal representa a temperatura ao longo do tempo, subindo e descendo para representar as mudanças de temperatura características de reações de amplificação de material genético. Acompanhando a linha, estão os parâmetros de cada etapa: a temperatura da reação e o tempo no qual o aparelho deve manter esta temperatura. Uma barra amarela vertical destaca a etapa presente do processo. No caso desta foto, esta barra indica que o aparelho está no processo de elevar a temperatura de 55 graus Celsius para 72 graus Celsius, na transição da penúltima para a última etapa de cada ciclo do Estágio 3 programado no aparelho. Abaixo do gráfico, temos uma série de botões digitais, na mesma tela, retangulares, na cor laranja, com as funções de Pausar, Exibir Informações do Método; Mostrar os tempos do Método; Pular Etapa e Interromper a Reação. Mais abaixo na tela, uma tarja indica quando foi iniciado o processo, indicando Duas e Cinco da manhã do dia dezessete de fevereiro de 2022. À direita desta tarja, temos um último botão, este circular, na cor verde e com um ponto de interrogação, para maiores informações e tirada de dúvidas sobre a operação do aparelho. Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de pesquisa. No foco principal da fotografia, temos duas pesquisadoras vestindo jalecos de laboratório em cor azul clara, toucas descartáveis para proteção capilar, máscaras do tipo PFF2, luvas descartáveis em cor azul fixadas à altura do punho com fita adesiva. A mulher da esquerda é mais alta, tem a pele na cor bege-amarronzada e sobrancelhas e cabelos pretos, enquanto a mulher à direita tem a pele bege clara e cabelos loiros, e usa óculos. A mulher à esquerda tem nas mãos uma caixa de papelão com tubos de tampa laranja não-utilizados, e retira da caixa um destes tubos. A mulher à direita dá suporte com as mãos a um suporte para tubos de tamanho pequeno (como tubos de microcentrífuga). Mais próximo à câmera, um pouco à frente das mãos da mulher à direita, temos outro destes suportes. Em primeiro plano, sobre a bancada e próximo à câmera, temos diversos suportes para tubos, preparados com duas fileiras de tubos cada, sendo uma delas composta por tubos de tampa transparente e a outra por tubos de tampa laranja. Ao fundo da fotografia, temos uma janela com vidros azulados, e uma diversidade de equipamentos e utensílios de laboratório. Fotografia ilustrando pesquisadora em processo de análise de dados utilizando computadores. À esquerda da imagem, temos uma mulher de pele bege clara, utilizando máscara facial do tipo PFF2, com roupas comuns — ou seja, sem equipamentos de proteção, uma vez que não está lidando diretamente com a bancada. Ela está vestida com uma camisa azul, e uma blusa preta por cima, com as mangas puxadas até a altura da base do antebraço. A mulher possui ainda cabelos castanho escuros com as pontas descoloridas, usa um esmalte em cor cinza-amarronzada e, no braço esquerdo, um relógio de pulso com pulseira em cor prata. A pesquisadora está sentada a uma mesa, e apenas seu busto está enquadrado na imagem. Sobre a mesa, temos um computador do tipo notebook e um monitor de computador grande, no qual são exibidos dois gráficos, um de barras e outro de área. No notebook está disposta a página do GISAID, o banco de dados internacional cooperativo para depósito e análise de sequências de genoma de Influenza e do SARS-CoV-2. Fotografia retratando um dos procedimentos na rotina de um laboratório de microbiologia. Na fotografia, em frente a uma parede branca, temos a visão lateral e traseira de um rosto coberto por máscara do tipo PFF2, com uma touca para proteção capilar disposta sobre cabelos pretos. Não é possível identificar nenhuma característica da fisionomia da pessoa, uma vez que muito pouco de seu rosto está visível. Mais à direita, temos, erguidas, as duas mãos desta pessoa pesquisadora, figurando na imagem a porção final dos antebraços, cobertos pelas mangas azuis de um avental descartável de laboratório, sobre as quais estão colocadas luvas azuis descartáveis. A pessoa segura nas mãos um pequeno suporte transparente, no qual estão depositados alguns tubos de amostras. A imagem sugere que esta pessoa observa algo nos tubos.

Polos de sequenciamento

Gráfico em fundo branco representando o Mapa do Brasil, com indicação de localização das Unidades da Fiocruz e as Instituições Parceiras que compõem a Rede de Vigilância Genômica da Fiocruz. O mapa consiste apenas nos contornos dos estados em preto, com o preenchimento na cor do fundo. Os estados brasileiros estão identificados por suas siglas, e marcados com um código de cores. Em azul, temos alfinetes de localização com o símbolo da Fiocruz (contorno em branco de um castelo com duas torres), indicando as Unidades: Fiocruz Amazônia, no estado do Amazonas; Fiocruz Rondônia, Fiocruz Mato Grosso do Sul, Fiocruz Paraná, Fiocruz Piauí, Fiocruz Ceará, Fiocruz Pernambuco, Fiocruz Bahia, Fiocruz Minas Gerais e Fiocruz Rio de Janeiro. As instituições vinculadas ao Ministério da Saúde estão representadas na cor roxa, na forma de pequenos círculos. Estes marcam os estados do Pará, Rio de Janeiro e São Paulo. Círculos amarelos, do mesmo tamanho dos roxos, marcam os Laboratórios Centrais de Saúde, nos estados do Acre, Pará, Paraíba, Sergipe, Espírito Santo, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Por fim, círculos verdes indicam outras instituições parceiras, nos estados do Rio Grande do Norte, Paraíba, Pernambuco, Goiás, São Paulo e Rio Grande do Sul. Os estados do Rio Grande do Norte e Goiás possuem duas instituições desta categoria cada. No canto inferior esquerdo do gráfico, temos a legenda, com as quatro categorias dispostas por escrito nas cores utilizadas para indicá-las no mapa.

O grupo conta com a colaboração das seguintes instituições

 Instituto Adolfo Lutz
Instituto Evandro Chagas
Laboratório Central de Saúde Pública do Espírito Santo
Laboratório Central de Saúde Pública do Pará
Laboratório Central de Saúde Pública da Paraíba
Laboratório Central de Saúde Pública de Santa Catarina
Laboratório Central de Saúde Pública de Sergipe
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul
Laboratório Central de Saúde Pública da Secretaria de Estado da Saúde do Acre
HLAGYN da Secretaria Municipal de Saúde de Aparecida de Goiânia
Laboratório de Vigilância Molecular Aplicada da Escola Técnica de Saúde Universidade Federal da Paraíba
Núcleo de Pesquisa em Inovação Terapêutica da Universidade Federal de Pernambuco
Laboratório de Virologia Clínica – Vírus Respiratórios do Departamento de Medicina da Universidade Federal de São Paulo
Laboratório de Análises Moleculares Avançadas da Faculdade de Ciências da Saúde do Trairi / Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Laboratório de Doenças Infecciosas e do Câncer do Departamento de Microbiologia e Parasitologia / Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Laboratório de Biologia Molecular e Sequenciamento da Universidade Federal de Santa Maria
Laboratório de Microfluídica da Universidade Federal de Goiás

Equipes Fiocruz