Estudo preliminar da Rede Genômica descreve a identificação e algumas características do genoma da variante N.10
Desde a chegada do novo coronavírus ao Brasil até abril de 2021, foram identificadas pelo menos três ocasiões nas quais as linhagens que circulam no país deram origem, pelo acúmulo de mutações, a variantes de alta relevância epidemiológica. Destas, uma foi classificada como variante de preocupação (VOC) e denominada P.1 segundo o sistema de nomenclatura PANGO, enquanto outras duas (denominadas P.2 e N.9) foram classificadas como variantes de interesse (VOI). As três variantes possuem a mutação E484K no domínio de ligação ao receptor (RBD) da glicoproteína Spike (proteína S), que propicia a ligação das partículas virais às células humanas, uma mutação aparentemente importante para o escape de anticorpos e consequentemente reinfecção de indivíduos que já se infectaram com outras linhagens do coronavirus. A variante possui esta modificação e um conjunto de outras mutações importantes que aumentam ainda mais a capacidade da linhagem de escapar dos anticorpos gerados após infecção natural ou vacinação.
A presente publicação (no fórum de discussão de pesquisas em virologia Virological.org, ainda sem revisão por outros grupos de pesquisa) descreve a identificação de uma terceira VOI, a N.10. Derivada da linhagem B.1.1.33 — a mesma que deu origem à N.9 — a N.10 foi identificada em amostras provenientes do estado do Maranhão e, além da mutação E484K, possui outra mutação no RBD da proteína S, além de diversas alterações e deleções de aminoácidos em outra porção da proteína, denominada domínio N-terminal (ou NTD). Mutações na NTD já foram associadas a um aumento na capacidade de linhagens como a P.1 de escapar da resposta imunológica mediada por anticorpos, o que torna esta variante, presente em 23% das amostras de Janeiro de 2021 provenientes do Maranhão analisadas, um possível motivo de alerta para o futuro próximo, especialmente se for observado um aumento significativo na sua prevalência.
Resende, P. C., Gräf, T., Lima Neto, L. G. et al. Identification of a new B.1.1.33 SARS-CoV-2 Variant of Interest (VOI) circulating in Brazil with mutation E484K and multiple deletions in the amino (N)-terminal domain of the Spike protein