N9: Identificada pela primeira vez entre 2020 e o início de 2021 uma nova variante do SARS-CoV-2, em amostras de dez estados brasileiros
(Publicado definitivamente sob o DOI: 10.3390/v13050724)
A pandemia do SARS-CoV-2 no Brasil foi dominada por duas linhagens principais ao longo de 2020 e o princípio de 2021. Dentre estas linhagens, a B.1.1.28 já deu origem a duas importantes variantes que carregam mutações na glicoproteína Spike (proteína S) como a substituição de aminoácidos E484K no domínio de ligação ao receptor (RBD), implicada como um dos principais fatores para o escape da neutralização por anticorpos contra o vírus. Estas linhagens são a variante de interesse (VOI) P.2 e a variante de preocupação (VOC) P.1. A P.1, provavelmente surgida em dezembro de 2020, se espalhou rapidamente pelo estado do Amazonas e alcançou outras regiões do país, e possui mutações adicionais que parecem conferir à variante uma capacidade aumentada de causar reinfecções, e maiores cargas virais em pacientes.
Esta publicação no fórum de discussão de pesquisas em virologia Virological.Org descreve a primeira variante brasileira positiva para a mutação E484K derivada da linhagem B.1.1.33, a outra linhagem dominante no Brasil. A VOI N.9 provavelmente surgiu em agosto de 2020, e sua descoberta a partir de amostras de dez estados (São Paulo, Santa Catarina, Amazonas, Pará, Bahia, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí e Sergipe) coletadas entre novembro de 2020 e fevereiro de 2021 evidencia seu rápido espalhamento pelo território nacional, reflexo de uma dificuldade em garantir o isolamento e distanciamento sociais e conter o fluxo de pessoas entre diferentes regiões brasileiras. Apesar deste espalhamento rápido, a N.9 parece ter uma baixa prevalência, correspondendo a aproximadamente 3% das amostras em escala nacional. Além de carregar a mutação E484K na proteína S, a N.9 possui ainda outras quatro mutações não-sinônimas que definem a linhagem.
Resende, P. C., Gräf, T., Paixão, A. C. D. et al. A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil
